（提高土壤肥力。这是生物肥料的主要功效，例如各种自生、联合或共生的固氮生物肥料，可以固定空气中的氮素，增加土壤中的含氮量；多种分解磷、钾矿物的微生物，如硅酸盐细菌能分解土壤中的钾长石、云母及磷矿石，使其中难溶的磷、钾有效化。（制造和协助农作物吸收营养。功能与作用机制有机肥：主要作用是改善土壤结构，增加土壤有机质含量，提高土壤肥力，为农作物提供全面的营养支持。生物菌肥：除了具备有机肥的所有功能外，还能通过微生物的活动促进土壤养分的释放和，提高肥料的利用率；同时，有益微生物还能抑制土壤中的病原菌和害虫。
生物菌肥中的微生物能够促进作物的根系发育，增强作物的光合作用，从而提高作物的产量。同时，微生物菌肥还能改善作物的品质，使作物更加健壮、口感更佳。施用微生物菌肥的作物与未施用的相比，取得的经济效益非常可观。培肥地力、活化土壤生物菌肥中的微生物能够分泌有机酸等活性物质，这些物质能够活化土壤中的养分。生物菌肥中的功能菌主要是通过土壤中的作用来提高肥料的利用效率。有机质为生物有机肥中的功能菌提供了生存环境，因此这种肥料在土壤中更容易存活。然而，生物菌肥中的功能菌可能并不适合所有土壤环境。有机肥价格相对便宜，每吨大约在,元，而生物菌肥的价格则较为昂贵，每吨价格可达上万元。
有机肥中的菌有什么好处EM菌处理发酵的微生物有机肥的好处：详细了解请上“EM菌药救急”生态养殖技术网调理土壤、激活土壤中微生物活跃率、克服土壤板结、增加土壤空气通透性。减少水分流失与蒸发、减轻干旱的压力、保肥、减少化肥、减轻盐碱损害，在减少化肥用量或逐步替代化肥的情况下，提高土壤肥力，使粮食作物、经济作物、蔬菜类。施用生物菌有机肥有诸多好处：①生物菌喷洒入动物和各种肥料中后，可迅速繁育，发生大量的有益生物菌，能根系的生长发育，促进扎根，使辣（甜）椒根系发达。并能在根系周围形成菌层，抑制并杀灭土壤中的有害菌类（真菌、细菌、植物病），显著减少土传病害发生。
专门购买的有机肥发酵剂如果需要快速发酵有机肥，可以选择购买专门的有机肥发酵剂。这些发酵剂中通常含有复合菌剂，包括多种有益微生物，如细菌、真菌等。这些微生物在发酵过程中能够协同作用，更快地分解有机物。菌剂标准：购买有机肥发酵剂时，应注意查看其有效活菌数。一般来说。达到生物控制病害的作用。根灌可以控制土壤中的病菌，喷洒在叶片上，起到防病的作用。使作物早熟，延长收获期。由于土壤理化性质的改良，土壤养分丰富而平衡，土壤中的肥料能更好地被作物吸收，所以能使作物早熟，延长采收期。与化肥不同，生物菌肥可以一次性将过量的可溶性养分带入土壤。
同时还能增强作物对不利环境综合防御能力。随着化肥施用量的减少，农产品中硝酸盐含量也相应降低。营养元素齐全，可以改善土壤和因使用化肥造成的土壤板结。改善土壤的理化性质，增强土壤保水、保肥、供肥能力。生物有机肥中的有益微生物进入土壤后和土壤中的微生物相互形成共生增殖关系。有机肥在农业生产中施用所显示的优点还包括：营养平衡，促进作物生长，增产明显，肥效高；改善农产品品质；抑制病原菌，减轻病虫害；疏松、改良土壤，减少土壤中硝酸盐的污染；增加作物对水分的吸收、增强作物抗旱及抗倒伏能力；经过科学的管理。
使用哪些菌种：参与堆肥过程的主要微生物种类是细菌、真菌以及放线菌.这,微生物都有中温菌和高温菌.作用：堆肥这种古老而简便的处理有机废弃物和制造肥料的方法,随着研究的深入和方法的改进,其作用很受各个国家的重视,因为它有很好的生态意义,也为农业生产带来效益.有许多报道指出。能够对有机肥起到无害化的作用有机肥发酵剂中的微生菌种通常是选育的一些高温好氧发酵菌，这些菌在有机肥发酵过程中，可以让物料的温度升高到,，而且可以保持,以上。这相当于一个巴氏灭菌过程能够杀灭有机肥原料中的病菌，对堆肥能够起到无害化的作用。
