有机肥在堆肥化过程实际上也是一种脱水工艺，而且由于其主要依赖微生物作用，不需要外部能量，因此往往具有低投入、低成本、产品增值使用等特征，受到处理界的欢迎。什么是生物有机肥生物有机肥就是在有机肥中添加了一些有益微生物菌类，目前这类肥料在市场上的交易量也是比较大的。有机肥的价格一般在,,之间，而生物有机肥的价格则更为昂贵。通常，这类肥料的氮磷钾含量大约在,,左右。当有机肥被混合到田地里，它会成为微生物的食物，促进这些微生物的繁殖。在这个过程中，细菌、真菌、各种昆虫、蚯蚓等不同大小的生物开始活跃起来。通过微生物分泌的黏液。
有机肥属于长效性肥料，可以持续为作物提供养分。可促进土壤团粒结构的形成，从而提高土壤的透气性。有机肥能够改变土壤三相（物理性、化学性、生物性），从而提高土壤的保水保肥保温能力，作物生长好了，自然对病虫害的抵抗能力也就增强了。有机肥的缺点：由于有机肥中的养分含量较化肥比较低。在当前的农业生态下，有机肥的综合性价比更高，无论成本还是功效都能够满足农作物的生长需求，甚至还能够在一定程度上促进农作物的生长，而这些优势是传统的农家肥所不具备的，因此有机肥能够在广大的农村地区得到广泛认可也就无可厚非，关键是有机肥种植出来的农作物，在价格上也明显高于其他肥料所种植出来的农产品。
如果仅用微生物肥或有机肥完全替代化肥，既追求产品品质，又追求产量，将使用投入的成本相对增高。对不追求农产品品质，只追求产量的一般大宗农产品来说，全部用成本相对较高的生物有机肥替代成本较低的化肥，成本显得较高。这种仅用化肥，既追求产量，有希望土地持续丰收的操作。有机肥可以替代化肥使用。上下五千年，古代没有化肥，而土壤也一直保持肥沃。长期使用有机肥，土壤有机质非常多，植物所需要的矿物质也非常多，并且比较齐全，除氮、磷、钾外，还含有钙、镁、硫、锌、硼、锰、钼、铜、铁。凡是植物所需要的矿物质，在农家有机肥中，都能找到，都能含有。
有机肥分为两种形态，一种是颗粒的有机肥料，另一种是粉状的有机肥料。如果生产颗粒的有机肥料，就需要计量设备，粉碎设备，搅拌设备，烘干设备、筛分设备，灌装设备，缝包设备。以年产,吨的圆盘造粒设备为例，设备投资约需,元左右。如果生产粉状的有机肥料，则只需要计量设备，粉碎设备。因为用做肥料，能提供作物生长所需养分，改良土壤，还可以改善作物品质，提高作物产量，促进作物高产稳产，保持土壤肥力。动物的物或动植物残体等富含有机质的副产品资源为主要原料,经发酵腐熟后而成的肥料。有机肥有改良土壤、培肥地力、提高土壤养分活力、净化土壤生态环境。
