使用生物有机肥具有多方面的好处，主要包括以下几点：提升土壤肥力：生物有机肥有效期长，肥力持久且缓和，无污染，是生产有机、绿色和无公害食品的优质肥料。它含有多种微量元素，能够增加土壤有机质含量，疏松土壤，改良土壤结构，有助于形成高标准农田。在化肥使用效果达到极限后。生物有机肥是指将特定功能微生物和动植物残体，经过腐熟和无害化处理的一种具有微生物肥料和有机肥效应的肥料。生物有机肥其原料包括豆饼、芝麻饼、秸秆、动物残体和沼肥等。生物有机肥的有机质含量高，具有改良土壤、保水保肥的作用，能够缓解因为长期施加肥料造成的土壤板结。
有机肥的肥效是由有益微生物的肥效和有机肥的肥效共同作用产生的，改良土壤结构有机肥是较好的土壤改良剂，可以使土壤团粒结构的形成和土壤物理形态的改良主要在于非毛管空隙度增加，大水稳性团粒增加，土壤结构改良，同时土壤通气。有机肥含有作物生长所需的养分。特点一是有机质吸附量大。微生物有机肥是什么肥料？微生物有机肥与传统有机肥不同，它主要含有微生物菌剂，这些菌剂能够提升作物对营养的吸收效率，促进土壤健康，并调节农作物的生长功能。微生物菌剂可以看作是农业中的“乳酸菌”，而生物有机肥就像是经过乳酸发酵的酸牛奶。它通过特定的微生物过程，成对作物有益的肥料。
生物有机肥的生产原料主要包括以下几类：农业废弃物：如秸秆、豆粕、棉粕等，这些废弃物在自然分解过程中能释放丰富的有机质和营养元素，有效促进土壤微生物活性。畜禽：如鸡粪、牛羊马粪、兔粪等，它们富含氮、磷、钾等植物生长所需的元素，不仅能够改善土壤结构，还能提高作物产量和品质。有机菌肥是生物有机肥。含有功能菌和有机质，能改良土壤，促使被土壤固定的养分释放。生物有机肥的有机质本身就是功能菌生活的环境，施入土壤后容易存活;而生物菌肥的功能菌可能不适合某些土壤环境。有机肥主要来源于植物和(或)动物,施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料.经生物物质。
主要包括微生物菌剂和生物有机肥。微生物菌剂含有大量有益微生物，能够改善土壤环境；生物有机肥则是将有机物与微生物结合，既提供养分又改善土壤质量。作用使用生物肥料的主要目的是提高土壤肥力，促进作物生长，并减少化学肥料的使用，从而降低农业对环境的不良影响。同时。有机肥通常是在人工控制和一定碳氮比，水分，通风情况下通过微生物发酵作用，成有机肥。通过堆肥化过程，是将不稳定的有机物为稳定的腐殖质过程。而生物有机肥则是在有机肥的基础上添加了微生物菌，有效活菌数(cfu)，亿/g≥,。无论是有机肥还是生物有机肥。
