促进根系发育：通过代谢产物的作用，微生物菌剂能够农作物的根系发育，使根系更加健壮，从而提高农作物对土壤养分和水分的吸收能力。增强农作物抗逆性：微生物菌剂的代谢产物还能增强农作物的抗病、抗旱、抗寒等能力，使农作物在面对不良环境时能够更好地生长和存活。综上所述。人工控制微生物代谢的措施包括改变微生物遗传特性、控制生产过程中的各种条件（即发酵条件）等。例如，短杆菌能够利用天冬氨酸合成赖氨酸、苏氨酸和甲硫氨酸。其中，赖氨酸是一种人和高等动物的必需氨基酸，在视频、医药和畜牧业上的需要量很大。在短杆菌的代谢过程中。
微生物次生代谢产物是指微生物在一定的生长时期，以初级代谢产物为前体，合成的一些对微生物的生命活动无明确功能的物质。以下是关于微生物次生代谢产物的详细解释：产生过程：微生物次生代谢是在微生物生长到一定阶段时发生的。它以初级代谢产物作为合成前体，进一步为次生代谢产物。微生物的代谢产物可以分为初级代谢产物和次级代谢产物。初级代谢产物是指微生物通过代谢活动所产生的、自身生长和繁殖所必需的物质，如氨基酸、核苷酸、多糖、脂类、维生素等。通过初级代谢，能使营养物为结构物质、具生理活性物质或为生长提供能量，因此初级代谢产物，通常都是机体生存必不可少的物质。
另外，微生物从环境中能够得到的营养物的种类必定有限，不能够满足需要，因此，微生物细胞会通过合成或分解代谢生产它必需的一些物质，包括氨基酸、核苷酸等等。这一切都是为满足微生物生存和繁殖的需要，人们就可以利用微生物的这种生产能力，生产各种有用的产品，如抗生素、氨基酸、酶等。微生物菌体发酵：以微生物菌体本身为产品，如酵母、细菌等。微生物酶发酵：以微生物产生的酶为产品，如淀粉酶、蛋白酶等。微生物代谢产物发酵：以微生物代谢产生的有机酸、氨基酸、抗生素等为产品。微生物的发酵：利用微生物对特定底物进行，产生所需产物，如酒精发酵、乳酸发酵等。生物工程细胞发酵：利用基因工程等技术改造的微生物细胞进行发酵，以生产特定产物。
